马达得知后，主张出兵讨伐于阗，但汉桓帝不希望西域战事扩大，否决了这一建议，将马达召回，改任宋亮为敦煌太守。宋亮到任后，要求于阗方面交出杀死王敬的主谋输僰。此时输僰已经死去，于阗方面便砍下输僰的人头送到敦煌，却隐瞒了实情。宋亮后来得知真相，但此时汉朝已无力再出兵惩戒，只能不了了之。此事之后，于阗看穿了汉朝的软弱，对朝廷日益骄横傲慢，不再服从管制。
永兴元年（公元153年），西域车师后部再次爆发内乱。车师后部王阿罗多与戊部候严皓关系不和，矛盾激化，最终起兵反叛，围攻汉朝屯田据点且固城，杀伤官兵百姓。后来因其部下将领投降汉朝，阿罗多势单力薄，被迫逃往北匈奴。敦煌太守宋亮随即拥立后部故王军就的质子卑君为新车师后部王。谁知不久之后，阿罗多从北匈奴返回，与卑君争夺王位。戊校尉阎详担心阿罗多会招引北匈奴大军入西域，彻底搅乱当地局势，便不顾既定安排，同意重新拥立阿罗多为王，将卑君召回敦煌安置。东汉朝廷对此次事件“曾莫惩革”，没有采取任何有力措施予以整顿纠正，自此之后，西域诸国对汉朝越发疏远傲慢，不再真心归附。
延熹元年（公元158年），南匈奴起兵反叛，侵犯凉州等边境地区，西北局势再度告急。汉桓帝任命种暠为度辽将军，主持西北边防。种暠到任之后，采取先抚后剿的策略，先以朝廷恩德招降各部胡人，对于顽固不降、继续作乱者，再出兵征讨。在他的治理之下，羌胡各部以及西域的龟兹、莎车、乌孙等国纷纷前来归顺，东汉王朝在西北与西域的统治权威，一度得到短暂恢复。
纵观汉桓帝刘志一朝，边疆战事几乎贯穿始终，羌乱、鲜卑入侵、南方蛮夷反叛、西域动荡此起彼伏，虽有段颎、张奂、皇甫规、种暠等一批贤臣名将竭力支撑，多次平定叛乱、击退外敌，维持了王朝版图的基本完整，但连年征战耗费了大量人力、物力、财力，进一步加剧了东汉王朝的国力损耗，为日后的统治危机埋下了深深的隐患。